Multioborový CEITEC je vůbec prvním typem vědeckého centra v ČR, které integruje výzkum a vývoj v oblasti věd o živé přírodě, pokročilých materiálů a technologií v takovém rozsahu. Instalované špičkové technologie umožní synergicky studovat objekty živé i neživé přírody na všech v současné době dostupných úrovních složitosti, počínaje jednotlivými atomy, přes molekuly, molekulární uskupení, buňky až po celé organismy.
CEITEC je postaven na vzájemné synergii 7 výzkumných programů. Hlavním integrujícím prvkem centra jsou sdílené laboratoře ("Core Facilities"). Z důvodu maximalizace spolupráce jsou soustředěny pouze do dvou lokalit, tj. kampusu Masarykovy univerzity v Brně – Bohunicích a kampusu Vysokého učení technického Pod Palackého vrchem v Brně – Králově Poli. Laboratoře v kampusu se orientují na přírodní vědy a medicínu, těží z blízkosti Fakultní nemocnice Brno a biomedicínského inkubátoru. V areálu Pod Palackého vrchem vznikne centrum pro materiálové vědy a pokročilé technologie. Obě části budou fungovat jako interdisciplinární vědecké pracoviště s celouniverzitní působností.