Popis programu
Většina lidských onemocnění se rozvíjí na základě genetických dispozic jedince nebo jsou způsobena infekčními agens. Kromě toho je také interakce lidského organizmu s infekčním činitelem ovlivněna geneticky, a to jak ze strany hostitele tak i patogenu. Proto jsou hlavní cíle programu
- využít moderních přístupů k analýze genomů (lidských i mikrobiálních):
- na molekulární úrovni studovat vlastnosti buněk související s nádorovou transformací a rezistencí vůči moderní protinádorové léčbě;
- analyzovat mechanizmy vedoucí k poruchám imunitní odpovědi organizmu.
Mezi nemoci studované v rámci projektu budou proto zahrnuta nádorová onemocnění, neuromuskulární, neurodegenerativní a metabolické poruchy, infekční choroby a defekty imunitního systému (primární a sekundární deficience, alergie, autoimunitní poruchy). Tyto oblasti patří mezi aktuální témata biomedicínckého výzkumu i klinické medicíny. Program si klade za cíl přinést nové poznatky o patogenezi uvedených onemocnění a vyvíjet experimentální strategie pro jejich léčbu a prevenci. Nové možnosti analýzy celého lidského genomu, které zahrnují komparativní a funkční genomiku a proteomiku, perspektivně umožní vytvoření specifické molekulární diagnostiky, rozvoj medicíny „šité na míru“ a zavedení genové terapie. Tyto cíle budou plněny v úzké spolupráci s řadou dalších programů v rámci projektu CEITEC.
Dílčí cíle programu
- Zavedení vysokokapacitních analýz lidského a mikrobiálního genomu a využití těchto technologií v medicíně. Analýza lidského transkriptomu a epigenetických změn.
- Mapování klíčových genetických defektů nádorových buněk. Genomická a proteomická analýza nádorových buněk s cílem predikovat léčebnou odpověď. Analýza buněčné rezistence vůči moderní protinádorové léčbě. Vyhledávání vhodných cílů genové terapie.
- Molekulárněgenetická diagnostika a charakterizace neuromuskulárních, neurodegenerativních a metabolických poruch.
- Charakterizace genomu nových, opětovně se šířících a sexuálně přenosných patogenů; identifikace a charakterizace genetických vlastností mikroorganizmů vcelogenomovém měřítku.
- Studium mechanizmů vedoucích k poruchám imunitní odpovědi organizmu, zvláště pak kvantitativních a kvalitativních defektů (primární a sekundární deficience, alergie, alergoonkologie, autoimunitní poruchy); analýza genů podílejících se na imunitní odpovědi.
- Rozvoj přístupů zlepšujících současné terapeutické protokoly a experimentální strategie, které si dávají za cíl navržení nových terapeutických metod.
Aplikace výsledků
- Lepší stratifikace pacientů s nádorovými a dědičnými onemocněními do prognostických skupin, která umožní medicínu „šitou na míru“.
- Rozvoj nových experimentálních strategií pro léčbu rakoviny.
- In vitro testování nových léčiv pro terapii vybraných onemocnění.
- Zlepšování léčebných protokolů u vybraných pacientů s nádorovými onemocněními.
- Identifikace mutací zodpovědných za vznik onemocnění. Hledání vzájemných vztahů mezi genotypem a fenotypem.
- Identifikace nových cílů pro diagnostiku a léčbu nových, opětovně se šířících a sexuálně přenosných patogenů.
- Mapování cest přenosu nozokomiálních infekcí, které pomůže omezit výskyt těchto infekcí v nemocničních zařízeních.
- Epidemiologické mapování mikroorganizmů sexuálně přenosných onemocnění umožňující zavedení účinnějších preventivních opatření.
- Zdokonalení diagnostiky za účelem lepšího odhadu závažnosti infekce a případných alergických a autoimunitních komplikací.
- Identifikace mikroorganizmů spojovaných sonemocněními s komplikovanou etiologií, zavedení nové léčby těchto nemocí.
- Objasnění patogeneze imunodeficitních a alergických onemocnění, nové možnosti léčby a terapie.
Výzkumné skupiny
- Výzkumná skupina Šárky Pospíšilové (Lékařská genomika)
- Výzkumná skupina Ondřeje Slabého (Molekulární onkologie - solidní nádory)
- Výzkumná skupina Dalibora Blažka (Dědiné poruchy - Transkripční regulace)
- Výzkumná skupina Dmitriye Chudakova (Skupina adaptivní imunity)
- ERA Chair - Výzkumná skupina Mary O'Connell (RNA a imunita)
- Výzkumná skupina Marka Mráze (Mikrosprostředí imunitních buněk)
-
Výzkumná skupina Michala Šmídy (Funkční genomika)