Centrální laboratoř Nanobiotechnologie

Hlavní činnost

Mikroskopie pomocí skenovací sondy pro zobrazování biologických vzorků – řezů tkání, buněk, jednotlivých biomolekul, jako jsou nukleové kyseliny nebo proteiny. Studium afinity u interakcí na molekulární úrovni.

Jedinečné vlastnosti

• Vizualizace a studie vzorků pomocí mikroskopie atomových sil (AFM) v suchém i kapalném stavu
• AFM v kombinaci s dalšími technikami: elektrochemie, optická a konfokální fluorescenční mikroskopie
• Nanolitografie, nanomechanické manipulace, imobilizace pomocí ink-jet systému
• Příprava vzorků pro AFM
• Měření pomocí AFM, statistické analýzy a filtrace dat
• Výroba a biokonjugace nanočástic

Základní přístrojové vybavení

• Mikroskop se skenovací sondou - Ntegra Vita / Solaris (NTMDT)
• AFM systém NanoWizzard3 (JPK)
• Automat pro silovou spektroskopii ForceRobot 300 (JPK)
• Automatizovaný AFM systém SolverNEXT (NTMDT)
• Depoziční systém na bázi ink-jet SciFlex Arrayer S3 (Scienion)

Sdílená laboratoř je součástí českého národního přidruženého centra INSTRUCT. 

Všechny sdílené laboratoře CEITEC jsou k dispozici externím uživatelům (z akademického prostředí i z firem). Čeští i zahraniční výzkumníci z univerzit a výzkumných institucí, kteří mají zájem o získání přístupu do sdílených laboratoří, mohou využít podpory výzkumné infrastruktury CIISB, financované Ministerstvem školství, mládeže a tělovýchovy ČR.

  

seznam / vizitky

Jméno a pozice	E-mail	Telefon
doc. RNDr. Petr Skládal, CSc. docent, vedoucí pracoviště		+420 54949 7659, +420 54949 7010
Mgr. Jan Přibyl, Ph.D. senior researcher		+420 54949 5606
Mgr. Karel Lacina, Ph.D. senior researcher		+420 54949 7611
Mgr. Veronika Horáčková, Ph.D. odborná pracovnice ve výzkumu		+420 54949 7676
Mgr. Matěj Pastucha odborný pracovník - PhD student		+420 54949 8517
Mgr. Zdeněk Farka, Ph.D. senior researcher		+420 54949 7674
Guido Caluori, M.Sc., Ph.D. odborný pracovník ve výzkumu - postdoc

VYBRANÉ PUBLIKACE

2017

• FARKA, Z; JURIIK, T; KOVAAR, D; TRNKOVA, L; SKLADAL, P, 2017:Nanoparticle-Based Immunochemical Biosensors and Assays: Recent Advances and Challenges. CHEMICAL REVIEWS
• FARKA, Z; MICKERT, MJ; HLAVACEK, A; SKLADAL, P; GORRIS, HH, 2017:Single Molecule Upconversion-Linked Immunosorbent Assay with Extended Dynamic Range for the Sensitive Detection of Diagnostic Biomarkers. ANALYTICAL CHEMISTRY 89 (21), p. 11825 - 11830.
• HLAVACEK, A; PETEREK, M; FARKA, Z; MICKERT, MJ; PRECHTL, L; KNOPP, D; GORRIS, HH, 2017:Rapid single-step upconversion-linked immunosorbent assay for diclofenac. MICROCHIMICA ACTA 184 (10), p. 4159 - 4165.
• LACINA, K; KUBESA, O; VANYSEK, P; HORACKOVA, V; MORAVEC, Z; SKLADAL, P, 2017:Selective electrocatalysis of reduced graphene oxide towards hydrogen peroxide aiming oxidases-based biosensing: Caution while interpreting. ELECTROCHIMICA ACTA 223 , p. 1 - 7.
• NARDONE, G; LA CRUZ, JOD; VRBSKY, J; MARTINI, C; PRIBYL, J; SKLADAL, P; PESL, M; CALUORI, G; PAGLIARI, S; MARTINO, F; MACECKOVA, Z; HAJDUCH, M; SANZ-GARCIA, A; PUGNO, NM; STOKIN, GB; FORTE, G, 2017:YAP regulates cell mechanics by controlling focal adhesion assembly. NATURE COMMUNICATIONS 8
• SKARKOVA, P; NOVOTNY, K; LUBAL, P; JEBAVA, A; PORIZKA, P; KLUS, J; FARKA, Z; HRDLICKA, A; KAISER, J, 2017:2d distribution mapping of quantum dots injected onto filtration paper by laser-induced breakdown spectroscopy. SPECTROCHIMICA ACTA PART B-ATOMIC SPECTROSCOPY 131 , p. 107 - 114.

2016

• CUNDERLOVA, V; HLAVACEK, A; HORNAKOVA, V; PETEREK, M; NEMECEK, D; HAMPL, A; EYER, L; SKLADAL, P, 2016:Catalytic nanocrystalline coordination polymers as an efficient peroxidase mimic for labeling and optical immunoassays. MICROCHIMICA ACTA 183 (2), p. 651 - 658.
• FARKA, Z; JURIK, T; PASTUCHA, M; KOVAR, D; LACINA, K; SKLADAL, P, 2016:Rapid Immunosensing of Salmonella Typhimurium Using Electrochemical Impedance Spectroscopy: the Effect of Sample Treatment. ELECTROANALYSIS 28 (8), p. 1803 - 1809.
• FARKA, Z; JURIK, T; PASTUCHA, M; SKLADAL, P, 2016:Enzymatic Precipitation Enhanced Surface Plasmon Resonance Immunosensor for the Detection of Salmonella in Powdered Milk. ANALYTICAL CHEMISTRY 88 (23), p. 11830 - 11836.
• HLAVACEK, A; FARKA, Z; HUBNER, M; HORNAKOVA, V; NEMECEK, D; NIESSNER, R; SKLADAL, P; KNOPP, D; GORRIS, HH, 2016:Competitive Upconversion-Linked Immunosorbent Assay for the Sensitive Detection of Diclofenac. ANALYTICAL CHEMISTRY 88 (11), p. 6011 - 6017.
• JURIK, T; PODESVA, P; FARKA, Z; KOVAR, D; SKLADAL, P; FORET, F, 2016:Nanostructured gold deposited in gelatin template applied for electrochemical assay of glucose in serum. ELECTROCHIMICA ACTA 188 , p. 277 - 285.
• LACINA, K; ZAK, J; SOPOUSEK, J; SZABO, Z; VACLAVEK, T; ZERAVIK, J; FIALA, P; SKLADAL, P, 2016:Transistor Amplifier as an Electrochemical Transducer with Intuitive Optical Read-out: Improving Its Performance with Simple Electronic Solutions. ELECTROCHIMICA ACTA 216 , p. 147 - 151.
• MAKHNEVA, E; MANAKHOV, A; SKLADAL, P; ZAJICKOVA, L, 2016:Development of effective QCM biosensors by cyclopropylamine plasma polymerization and antibody immobilization using cross-linking reactions. SURFACE & COATINGS TECHNOLOGY 290 , p. 116 - 123.
• MANAKHOV, A; MAKHNEVA, E; SKLADAL, P; NECAS, D; CECHAL, J; KALINA, L; ELIAS, M; ZAJICKOVA, L, 2016:The robust bio-immobilization based on pulsed plasma polymerization of cyclopropylamine and glutaraldehyde coupling chemistry. APPLIED SURFACE SCIENCE 360 , p. 28 - 36.
• PESL, M; PRIBYL, J; ACIMOVIC, I; VILOTIC, A; JELINKOVA, S; SALYKIN, A; LACAMPAGNE, A; DVORAK, P; MELI, AC; SKLADAL, P; ROTREKL, V, 2016:Atomic force microscopy combined with human pluripotent stem cell derived cardiomyocytes for biomechanical sensing. BIOSENSORS & BIOELECTRONICS 85 , p. 751 - 757.
• SEDLMEIER, A; HLAVACEK, A; BIRNER, L; MICKERT, MJ; MUHR, V; HIRSCH, T; CORSTJENS, PLAM; TANKE, HJ; SOUKKA, T; GORRIS, HH, 2016:Highly Sensitive Laser Scanning of Photon-Upconverting Nanoparticles on a Macroscopic Scale. ANALYTICAL CHEMISTRY 88 (3), p. 1835 - 1841.
• ZERAVIK, J; FOHLEROVA, Z; MILOVANOVIC, M; KUBESA, O; ZEISBERGEROVA, M; LACINA, K; PETROVIC, A; GLATZ, Z; SKLADAL, P, 2016:Various instrumental approaches for determination of organic acids in wines. FOOD CHEMISTRY 194 , p. 432 - 440.

2015

• FARKA, Z; KOVAR, D; SKLADAL, P, 2015:Rapid Detection of Microorganisms Based on Active and Passive Modes of QCM. SENSORS 15 (1), p. 79 - 92.
• LACINA, K; SKLADAL, P, 2015:Bipolar transistor amplifier for transduction of electrochemical response to visual perception. SENSORS AND ACTUATORS B-CHEMICAL 210 , p. 183 - 189.
• SUN, XL; LACINA, K; RAMSAMY, EC; FLOWER, SE; FOSSEY, JS; QIAN, XH; ANSLYN, EV; BULL, SD; JAMES, TD, 2015:Reaction-based Indicator displacement Assay (RIA) for the selective colorimetric and fluorometric detection of peroxynitrite. CHEMICAL SCIENCE 6 (5), p. 2963 - 2967.

2014

• HLAVACEK, A; SEDLMEIER, A; SKLADAL, P; GORRIS, HH, 2014:Electrophoretic Characterization and Purification of Silica-Coated Photon-Upconverting Nanoparticles and Their Bioconjugates. ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES 6 (9), p. 6930 - 6935.
• KOVAR, D; FARKA, Z; SKLADAL, P, 2014:Detection of Aerosolized Biological Agents Using the Piezoelectric Immunosensor. ANALYTICAL CHEMISTRY 86 (17), p. 8680 - 8686.
• MANAKHOV, A; SKLADAL, P; NECAS, D; CECHAL, J; POLCAK, J; ELIAS, M; ZAJICKOVA, L, 2014:Cyclopropylamine plasma polymers deposited onto quartz crystal microbalance for biosensing application. PHYSICA STATUS SOLIDI A-APPLICATIONS AND MATERIALS SCIENCE 211 (12), p. 2801 - 2808.
• PESL, M; IVANA, A; PRIBYL, J; HEZOVA, R; VILOTIC, A; AIMOND, F; FAUCONNIER, J; VRBSKY, J; KRUZLIAK, P; SKLADAL, P; KARA, T; ROTREKL, V; LACAMPAGNE, A; DVORAK, P; MELI, AC, 2014:Molecular and Functional Characterization of Uniform-Sized Beating Embryoid Bodies and Cardiomyocytes from Human Embryonic and Induced Pluripotent Stem Cells. BIOPHYSICAL JOURNAL 106 (2), p. 565A - 565A.

2013

• FARKA, Z; KOVAR, D; SKLADAL, P, 2013:PIEZOELECTRIC BIOSENSOR COUPLED TO CYCLONE AIR SAMPLER FOR DETECTION OF MICROORGANISMS. CHEMICKE LISTY 107 , p. S302 - S304.

2012

• HLAVACEK, A; SKLADAL, P, 2012:Isotachophoretic purification of nanoparticles: Tuning optical properties of quantum dots. ELECTROPHORESIS 33 (42286), p. 1427 - 1430.
• SKLADAL, P; SVABENSKA, E; ZERAVIK, J; PRIBYL, J; SISKOVA, P; TJARNHAGE, T; GUSTAFSON, I, 2012:Electrochemical Immunosensor Coupled to Cyclone Air Sampler for Detection of Escherichia coli DH5 alpha in Bioaerosols. ELECTROANALYSIS 24 (3), p. 539 - 546.

2011

• NAGY, L; ANGYAL, T; NAGY, G; AKIKO, M; PRIBYL, J; SKLADAL, P, 2011:SENSITIVE ELECTROCHEMICAL METHOD DEVELOPMENT For "in vivo" Measurement of ROS in Ethanol Induced Stress. BIODEVICES 2011 , p. 359 - 362.

2010

• CRHA, I; PRIBYL, J; SKLADAL, P; ZAKOVA, J; VENTRUBA, P; POHANKA, M, 2010:Determination of the surface pathology of human sperm by atomic force microscopy. HUMAN REPRODUCTION 25 , p. I122 - I122.
• ZERAVIK, J; LACINA, K; JILEK, M; VLCEK, J; SKLADAL, P, 2010:Biosensor for determination of carboxylic acids in wines based on the inhibition of sarcosine oxidase. MICROCHIMICA ACTA 170 (3 IV), p. 251 - 256.

PROJEKTY

• RIAT-CZ (ATCZ40), Interreg CZ-AT, 2016 - 2018
• CIISB4HEALTH - Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii pro lidské zdraví (CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_013/0001776), MEYS, 2017 - 2021
• CIISB - České centrum pro integrativní strukturní biologii (LM2015043), MEYS, 2016 - 2019

Filter

Filtr Search Research group / CF — vyberte hodnotu — Funkční vlastnosti nanostruktur - Josef HumlíčekChytré nanonástroje - Jaromír HubálekExperimentální biofotonika - Radim ChmelíkPříprava a charakterizace nanostruktur - Tomáš ŠikolaVývoj metod analýzy a měření - Petr KlapetekCharakterizace materiálů a pokročilé povlaky - Jozef KaiserPlazmové technologie - Lenka ZajíčkováSyntéza a analýza nanostruktur - Jiří PinkasVíceškálové modelování a měření fyzikálních vlastností - Roman GrögerPokročilé keramické materiály - Martin TrunecKybernetika pro materiálové vědy - Pavel VáclavekPokročilé polymerní materiály a kompozity - Josef JančářPokročilé kovové materiály a kompozity na bázi kovůGlykobiochemie - Michaela WimmerováMolekulární mikrobiologie - Alois ČížekZoonózy - Břetislav KoudelaOrtopedie a chirurgie - Pavel ProksImunogenomika zvířat - Petr HořínCytogenomika zvířat - Jiří RubešReprodukce savců - Martin AngerBehaviorální a sociální neurovědy - Milan BrázdilAplikované neurovědy - Irena RektorováLékařská genomika - Šárka PospíšilováMolekulární onkologie - solidní nádory - Ondřej SlabýDědičné poruchy - Transkripční regulace - Dalibor BlažekSkupina adaptivní imunity - Dmitriy ChudakovBioanalytická instrumentace - František ForetCytogenomika rostlin - Martin LysákFunkční genomika a proteomika rostlin - Jan HejátkoInterakce hormonálních drah ve vývoji rostlin - Helene Robert BoisivonProteomika - Zbyněk ZdráhalVývojová a buněčná biologie rostlin - Tomasz NodzynskiMolekulární komplexy chromatinu - Jiří FajkusVývojová a produkční biologie - omické přístupy - Břetislav BrzobohatýStresová signalizace a adaptace rostlin - Vanesa Beatriz TognettiMolekulární biologie rostlin - Karel ŘíhaKontrola kvality RNA - Štěpánka VaňáčováNanobiotechnologie - Petr SkládalRegulace genové exprese prostřednictvím RNA - Peter LukavskyStrukturní biologie genové regulace - Richard ŠteflStrukturní virologie - Pavel PlevkaStruktura a dynamika nukleových kyselin - Jiří ŠponerStruktura a interakce biomolekul na površích - Miroslav FojtaVýpočetní chemie - Jaroslav KočaMultimodální a funkční neurozobrazování - Ivan RektorCF: Centrální laboratoř GenomikaCF: Centrální laboratoř RTG difrakce a Bio-SAXSCF: CEITEC NanoCF: Národní NMR centrum Josefa DadokaCF: Centrální laboratoř Interakce a krystalizace biomolekulCF: Centrální laboratoř Kryo-elektronová mikroskopie a tomografieCF: Centrální laboratoř ProteomikaCF: Laboratoř multimodálního a funkčního zobrazováníCF: Centrální laboratoř NanobiotechnologieStruktura biosystémů a molekulárních materiálů - Radek MarekNekódující genom - Lukáš TrantírekStruktura a dynamika proteinů - Lukáš ŽídekInterakce proteiny-DNA - Konstantinos TripsianesERA Chair - RNA a imunita - Mary O'ConnellMikroprostředí imunitních buněk - Marek MrázCF: Buněčné zobrazováníCF: Laboratoř rostlinného výzkumuFunkční genomika - Michal ŠmídaInterakce protein-protein a protein-membrána - Robert VáchaMagneto-Optická a THz Spektroskopie - Petr NeugebauerMolekulární nanostruktury na površích - Jan ČechalNanomagnetismus a spintronika - Vojtěch Uhlíř Institution — vyberte hodnotu — Centrála CEITECCEITEC Masarykova univerzitaCEITEC Vysoké učení technické v BrněCEITEC Mendelova univerzita v BrněCEITEC Veterinární a farmaceutická univerzita BrnoCEITEC Ústav fyziky materiálů, Akademie věd ČRCEITEC Výzkumný ústav veterinárního lékařství Technology — vyberte hodnotu — Nanolitography infrastructureChemical & Thermal processesEtching & DepositionPackaging & TestingElectrical & Magnetic measurementsOptical measurementsProbe microscopy & NanomanipulationIn situ fabrication & CharacterizationLiquid ChromatographyElectrophoresisX-ray DiffractionX-ray ScatteringBiomolecular Interactions and characterizationBiomolecular crystallizationConfocal microscopyWidefield microscopyConfocal microscopy for live cell imagingPhytotronsSmall-size growth chambersGreenhouse

Equipment	Research group / CF	Profile card
AFM microscopy system for nanobiointeractios	CF: Core Facility Nanobiotechnology
Combined AFM / inverted optical microscope	CF: Core Facility Nanobiotechnology
Electrochemical AFM and STM module, nanolithographic module	CF: Core Facility Nanobiotechnology
Entry-level AFM microscope	CF: Core Facility Nanobiotechnology
Fluorescence imaging of surfaces with resolution 0.5-40 um/px, multi-laser excitation	CF: Core Facility Nanobiotechnology
Nanodeposition system for protein chips	CF: Core Facility Nanobiotechnology
SPR module with goniometer	CF: Core Facility Nanobiotechnology